本标准于 2019 年立项（项目编号 spaq-2019-102）。2019年10月项目启动，进行前期收集资料和行业调研，2020 年 4 月召开项目启动会，2020 年 5 月至 2021 年 6 月开展标准文本修订，多次召开工作组会及专家研讨会，对标准内容进行讨论及完善修改，2021年7月形成草案。2021 年 9 月-2022年10月，召开多次行业征求意见会和专家讨论会， 并根据意见进一步收集相关营养成分含量数据资料，对重点问题进行研讨。基本形成标准文稿。2022 年 12 月15日-12月29日进行行业内征求意见，随后根据反馈意见进一步修改标准文本。2023年期间，召开多次行业意见沟通会以及监管部门沟通会，最终形成《食品安全国家标准 特殊膳食用食品标签》草稿。2025年3月26日-27日经第二届食品安全国家标准审评委员会营养与特殊膳食食品专业委员会第十五次会议审查通过。